NGS Core Center

Foto: Torsten Christensen/NGC

Generelt

MOMA NGS Core Center producerer NGS-data med udstyr fra Illumina, som er markedsførende.

De mest almindelige sekventeringsmetoder tilbydes af uddannet personale, som har adgang til et fuldt udstyret og automatiseret laboratorium, herunder robotter til væske-håndtering.

Teknologien udvikler sig hurtig: nye protokoller og nyt udstyr introduceres flere gange årligt.

Core centeret blev etableret i januar 2012 i samarbejde mellem Aarhus Universitetshospital, Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet ved Aarhus Universitet og forskerne ved MOMA.

Dataanalyse

Der bliver genereret en stor mængde data, derfor udfører MOMAs kvalificerede bioinformatikere den indledende bioinformatiske dataanalyse. De efterfølgende down-stream analyser gennemføres af brugeren af core centret.

Ved behov for støtte til det indledende design af kliniske forskningsprojekter der omfatter genomiske data eller efterfølgende analyse heraf, henviser vi til datastøttecenter CONNECT - Center for Kliniske og Genomiske Data som kan bistå anvendelse, analysen, og sammenholdelse af genomiske og kliniske data.

Services

Helgenom sekventering
Exom sekventering
RNA sekventering
små genpanel sekventering
Amplicon/16S sekventering
Sekventering af biblioteker
Sanger sekventering / fragmentanalyse
cfDNA og ctDNA analyser
indledende databehandling

Teknologi

NGS core centeret tilbyder massiv parallel next-generation sekventering på MiSeq, NextSeq 500 eller NovaSeq. Alle instrumenter er leveret og supporteret af Illumina, Inc. og opdateret med den nyeste hardware og software.
For mere information omkring specifikationer og performance se venligst www.illumina.com.

Typisk workflow

For flere detaljer se dokumentet:

Sample Requirements and Data Analysis (pdf)

Procedure

Kontakt os for flere informationer og priser.

Vi arranger et kort projektmøde, hvor vi diskuterer detaljer som studie design, targetering, biblioteksfremstilling og databehandling. Vores videnskabelige medarbejdere vil hjælpe dig med at finde et passende design for dit projekt.

Før vi kan processere dine prøver, skal der udarbejdes en kundekontrakt inklusive tidsplan.

Efter prøverne er blevet sekventeret, vil MOMA gennemføre den indledende databehandling. Derefter overdrager vi data personligt efter aftale.